摘要：為探究海水養(yǎng)殖石首魚(yú)類(lèi)腸道菌群的結(jié)構(gòu)特征及宿主遺傳因素對(duì)腸道菌群的影響，實(shí)驗(yàn)采用基于Illumina Hiseq2500測(cè)序平臺(tái)的高通量測(cè)序技術(shù)，對(duì)福建寧德三都澳養(yǎng)殖的5種石首魚(yú)類(lèi)(大黃魚(yú)、黃姑魚(yú)、狀黃姑魚(yú)、和眼斑擬石首魚(yú))的腸道菌群進(jìn)行16S rDNA V3～V4區(qū)測(cè)序分析。各樣本得到unique tags的數(shù)目為20 351～43 347個(gè)，上述5種魚(yú)類(lèi)分別得到479、626、603、518和556個(gè)操作分類(lèi)單元(OTUs)，分類(lèi)注釋結(jié)果顯示，這些OTUs可劃歸33門(mén)273屬。5種石首魚(yú)類(lèi)腸道內(nèi)容物和腸道壁樣品均以變形菌門(mén)、擬桿菌門(mén)和厚壁菌門(mén)細(xì)菌為主要優(yōu)勢(shì)菌群，約占總菌量的70%，在大黃魚(yú)腸道菌群中，螺旋菌門(mén)細(xì)菌占比達(dá)26.19%，也是其主要優(yōu)勢(shì)菌群。在屬分類(lèi)水平上，芽孢桿菌屬、發(fā)光桿菌屬、弧菌屬、金黃桿菌屬、鞘氨醇單胞菌屬及假單胞菌屬等屬細(xì)菌是5種養(yǎng)殖石首魚(yú)類(lèi)的主要類(lèi)別。腸道菌群多樣性的分析表明，Shannon多樣性指數(shù)：黃姑魚(yú)>狀黃姑魚(yú)>眼斑擬石首魚(yú)>>大黃魚(yú)，這些養(yǎng)殖石首魚(yú)類(lèi)的腸道內(nèi)容物菌群的多樣性均高于腸道壁。對(duì)上述魚(yú)類(lèi)種間的腸道菌群差異性分析顯示，大黃魚(yú)與眼斑擬石首魚(yú)之間腸道菌群的相似度要高于黃姑魚(yú)、狀黃姑魚(yú)和，而黃姑魚(yú)、狀黃姑魚(yú)和間的相似度較高。研究表明，5種海水養(yǎng)殖石首魚(yú)類(lèi)腸道菌群中存在自身特色的核心菌群，腸道菌群結(jié)構(gòu)的差異與種類(lèi)間的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系相似，說(shuō)明腸道菌群結(jié)構(gòu)與宿主遺傳因素密切相關(guān)。本研究可為養(yǎng)殖石首魚(yú)類(lèi)飼料及益生制劑的開(kāi)發(fā)、病害的防控等提供科學(xué)依據(jù)，并為宿主遺傳因素對(duì)魚(yú)類(lèi)腸道菌群影響的研究提供相關(guān)實(shí)驗(yàn)證據(jù)。
